近几年，随着医院污水排放标准的不断提高，国内部分城市开始着手改进原有的处理工艺或优化处理工艺，使污水排放达到新的排放标准。但是，由于经济条件的限制，有相当一部分省市的医院污水排放标准不高，医院污水处理工艺相对落后。而选用自动化的操作管理，处理效果好、投资少、占地少，是大势所趋。

1、一级。医疗废物一级处理工艺适合于污水排放到市政排水系统的医院，特别是一些综合性医院。常用的方法有一级沉淀、沉淀法。从我国目前的情况来看，大部分城市医院污水处理后排入城市下水道，所以一般只进行一级处理。但是，随着医院污水排放标准的提高，为确保处理后出水质量，部分大城市医院也积极采取了二次处理。

2、二级处理。二级医院废水一般采用生物处理，常用的处理方法有生物转盘、生物接触氧化法、射流曝气法、氧化沟技术、塔式生物滤池等。这类工艺为生物氧化，一般采用鼓风曝气，机械曝气等。这就使得污水中的大量微生物吸附和氧化污水中的有机物等有害物质。二次处理工艺适用于医院污水排放地表水的情况，能综合处理污水的生物污染、理化污染及有毒有害物质。生化氧化出水水质良好，但产生的污泥量大，需要进行污泥处理，增加了处理工艺和成本。与此同时，曝气会对大气产生二次污染：另外，生物法处理的污水停留时间长，工艺设备面积大等缺点。为此，大部分医院对原有工艺或新建的污水深度处理方案进行改造，提高出水水质，使之达到排放标准。

3、消毒处理。医疗废水消毒有多种方法，大致可分为物理法和化学法。物理法有辐射法、紫外法、加热法和冷冻法。医疗废水处理中，一般都是采用物理消毒方法，污水处理效果往往不像化学方法那么明显，但该方法具有不产生二次污染的突出优点。紫外光灭菌是一种常用的物理方法，具有设备简单、维修方便、无二次污染等特点。其缺点是污水的预处理要求严格，处理水量少，容易受到有机物的干扰，不能持续消毒。医疗废水的化学处理方法主要有：卤素、臭氧、重金属离子、阳离子型表面活性剂。

当前，我国医院污水消毒主要使用漂白粉、液级硫代硫酸钠等。医疗废水的处理主要有：常规处理、生物接触氧化、AB等。每一种方法都有各自的优缺点，应根据情况选用。